CONACEF es una corporación integrada por instituciones, no por personas naturales. Por su rol y relevancia profesional, académica o científica, las instituciones asociadas en CONACEF proveen a esta corporación tanto de la autonomía como de la autoridad para obrar de forma idónea como instancia de certificación de especialidades farmacéuticas en Chile. Las instituciones asociadas pueden tener la condición de “socios activos” o de “patrocinadores”. Pueden ser socios activos las instituciones fundadoras de CONACEF (Colegio de Químicos Farmacéuticos y Bioquímicos de Chile A.G. y Academia de Ciencias Farmacéuticas de Chile) y las sociedades científicas y universidades chilenas que, cumpliendo los requisitos, sean aceptadas en tal calidad por el Directorio. Pueden ser patrocinadores las personas jurídicas, que por sus aportes al progreso de la ciencia farmacéutica o su práctica, o por circunstancias de especial significación para el desenvolvimiento de la Corporación y sus fines, sean honrados con tal designación por la Asamblea General.
En la actualidad CONACEF está compuesto sólo por socios activos, los cuales firmaron el acta de constitución de la Corporación en 2003. Cada institución asociada aporta con dos apoderados a la asamblea general. De este modo, CONACEF se compone actualmente de las siguientes instituciones:Los apoderados para el periodo 2024-2026 son:
· Academia de Ciencias Farmacéuticas de Chile: Rosemarie Mellado Suazo y Marcelo Santibáñez Martínez.
· Colegio de Químicos-Farmacéuticos de Chile A.G.: Alejandra Araya Alar e Ignacio Sánchez Lombardi.
· Sociedad Chilena de Farmacia Asistencial: Rodrigo Orellana Bravo.
· Sociedad Chilena de Laboratorio Clínico y Forense: Víctor Vidal Pérez y Susana Valdevenito Alcaíno.
· Universidad Austral de Chile: Guido Ruiz Barría y Daniel Muñoz Pichuante.
· Universidad de Chile: Marcela Jirón Aliste y Javier Morales Valenzuela.
· Universidad de Concepción: Pedro Novoa Gündel y Ricardo Godoy Ramos.
· Universidad de Valparaíso: Yanneth Moya Olave y Cecilia Rubio Lagos.